23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0620 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0620    100 
 
 		 1095 bp  2171    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1746  hypothetical protein  85.07 
 
 		 441 bp  149  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0533978  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  84.29 
 
 		 1095 bp  103  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  89.09 
 
 		 1080 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0953  ISRSO5-transposase protein  92.86 
 
 		 435 bp  60  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0694776  normal  0.301746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  86.67 
 
 		 1113 bp  56  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  84.72 
 
 		 1089 bp  56  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  84.72 
 
 		 1089 bp  56  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  84.72 
 
 		 1089 bp  56  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  84.72 
 
 		 1170 bp  56  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  89.36 
 
 		 729 bp  54  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  100 
 
 		 1101 bp  54  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1873    94.29 
 
 		 1036 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  94.29 
 
 		 1092 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    90.48 
 
 		 1113 bp  52  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4091    85.48 
 
 		 273 bp  52  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  87.5 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4703    87.5 
 
 		 870 bp  48.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>