15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0556 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  65 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  60.35 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  57.19 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  56.38 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  58.19 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  57.93 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  52.9 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  50.34 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  51.4 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  46.69 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  43.79 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.6 
 
 		 951 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  25.11 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  25.16 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>