31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0450 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  52.63 
 
 		 292 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  50.17 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  52.63 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  52.63 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  52.28 
 
 		 292 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  47.92 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  51.24 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  51.76 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  51.06 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  50.7 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  48.75 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  50.53 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  48.38 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  47.69 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  46.49 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  31.58 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  32.28 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  30.81 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  31.44 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  28.27 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  30.16 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  30.85 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  28.79 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  25.45 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  25.55 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  28.5 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  27.33 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  24.88 
 
 		 553 aa  49.7  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  26.32 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>