36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0106 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  62.7 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  57.5 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  57.74 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.74 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.75 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  37.13 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  35.9 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 504 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.45 
 
 		 494 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  25.55 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  27.71 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.11 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.59 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  29.82 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  24.65 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.09 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  29.6 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  24.19 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  25.19 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.87 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0782  hypothetical protein  24.08 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24543  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.15 
 
 		 529 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.97 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  22.91 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  24.15 
 
 		 331 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.61 
 
 		 400 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 		 400 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.6 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  25.12 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  23.26 
 
 		 328 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 331 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  24.78 
 
 		 258 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>