262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2404 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  100 
 
 
142 aa  286  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  84.4 
 
 
143 aa  246  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  78.42 
 
 
144 aa  233  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  77.54 
 
 
143 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  77.86 
 
 
145 aa  224  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  78.26 
 
 
141 aa  223  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  77.54 
 
 
317 aa  222  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  76.43 
 
 
145 aa  220  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  74.82 
 
 
141 aa  220  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  72.86 
 
 
141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  72.26 
 
 
140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  75 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  73.57 
 
 
141 aa  216  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  73.91 
 
 
141 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  73.38 
 
 
145 aa  214  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  72.86 
 
 
141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  73.38 
 
 
141 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  70.8 
 
 
140 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  74.29 
 
 
141 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  72.66 
 
 
145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  72.66 
 
 
142 aa  209  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  72.66 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  71.43 
 
 
141 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  70 
 
 
141 aa  206  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  70 
 
 
146 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  70.07 
 
 
140 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  65.96 
 
 
143 aa  203  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  70.8 
 
 
140 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  71.01 
 
 
142 aa  202  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  66.43 
 
 
140 aa  199  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  68.61 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  65.71 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  67.14 
 
 
140 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  65.69 
 
 
148 aa  197  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  66.43 
 
 
140 aa  196  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  64.29 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  68.61 
 
 
144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  74.1 
 
 
141 aa  192  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  63.57 
 
 
141 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  63.77 
 
 
140 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  63.12 
 
 
143 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  63.57 
 
 
140 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  65 
 
 
140 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  64.29 
 
 
142 aa  190  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  63.04 
 
 
142 aa  189  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  65.71 
 
 
140 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  64.29 
 
 
140 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  65 
 
 
143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  64.71 
 
 
162 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  60 
 
 
141 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  62.5 
 
 
140 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  63.57 
 
 
140 aa  185  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  60 
 
 
141 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  59.29 
 
 
141 aa  183  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  60.71 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  62.14 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  60.71 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  58.57 
 
 
141 aa  180  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  62.04 
 
 
151 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  58.87 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  63.64 
 
 
134 aa  176  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  65.89 
 
 
138 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  57.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  65.15 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  59.4 
 
 
276 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  63.57 
 
 
139 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  63.57 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  62.79 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  57.35 
 
 
137 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  62.39 
 
 
121 aa  157  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  59.54 
 
 
132 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  62.28 
 
 
115 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  61.4 
 
 
115 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  57.36 
 
 
141 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  51.11 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  54.2 
 
 
136 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  53.12 
 
 
134 aa  140  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  48.89 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  53.1 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  49.28 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  50 
 
 
143 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  47.83 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  48.8 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  47.83 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  56.52 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  52.17 
 
 
142 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  52.14 
 
 
125 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.435432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  51.3 
 
 
113 aa  120  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  46.55 
 
 
127 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  52.63 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  53.1 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  49.12 
 
 
116 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4629  arsenate reductase  50.89 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12717  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4250  arsenate reductase  50.89 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4336  arsenate reductase  50.89 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0780089  normal  0.281607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>