77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1805 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  100 
 
 		 178 aa  340  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  45.99 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1955  colicin V production protein  43.71 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  23.84 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  28.29 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  26.4 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  25.84 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  27.22 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  26.32 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  24.43 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  33.53 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  29.87 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  23.3 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  28.31 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  26.14 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  23.43 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  36.79 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  29.38 
 
 		 232 aa  51.2  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.33 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  22.95 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  26.19 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  27.89 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  24.43 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  20.77 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  23.2 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  25.7 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  28.32 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  25.5 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  27.27 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  34.58 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  34.58 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  36.45 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  36.45 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  36.45 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  31.01 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  29.59 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  27.65 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  27.42 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  31.03 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  27.65 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  32.47 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  35.51 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  26.19 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  22.6 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  23.29 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  30.17 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  22.6 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  22.6 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  23.85 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  23.24 
 
 		 160 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  31.33 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  30.07 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  27.59 
 
 		 162 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  32.71 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  28.1 
 
 		 197 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  25.52 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  28.1 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.17 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  25.52 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  28.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  26.04 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  29.94 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  24.83 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  26.39 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  31.58 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>