44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1622 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  37.66 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  63.16 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  46.3 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  70.97 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  59.46 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  72.41 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  72.41 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  57.58 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  62.5 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  62.07 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  35.21 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  68.97 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  32.26 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  51.35 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  42 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  45.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.21 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  58.62 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.39 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  57.14 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 95 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>