25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0714 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0714  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  45.12 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  29.79 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  24.49 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  24.1 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  31.82 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  23.95 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  31.98 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  30.18 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  23.49 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  24.66 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  24.55 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  23.27 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  22.89 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  23.27 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  23.27 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  23.27 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  29.34 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  23.5 
 
 
452 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  21.69 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  32.09 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  23.08 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00669  hypothetical protein  26.04 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  28.46 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>