49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2949 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  100 
 
 		 241 aa  507  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  92.95 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  54.69 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  54.07 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  54.29 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  50.2 
 
 		 250 aa  264  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  50 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  49.8 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  49.38 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  48.96 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  44.03 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  46.19 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  46.19 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  46.19 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  40.15 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  36.84 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  34.63 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  36.28 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  35.22 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  35.22 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  35.56 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  34.76 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  34.78 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  36 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  36 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  34.76 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  34.76 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  35.5 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  35.5 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  35.29 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  35.65 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  34.35 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  34.35 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  35.22 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  34.17 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  26.83 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  26.72 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  27.64 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  26.72 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  26.83 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  26.83 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  35.4 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  25.91 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  30.22 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0777557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>