More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1902 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2341  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.61 
 
 		 510 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1902  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 508 aa  1050    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2794  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.22 
 
 		 511 aa  794    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000310387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1461  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.89 
 
 		 517 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2824  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.98 
 
 		 508 aa  948    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01255  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.1 
 
 		 517 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.602496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2969  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.78 
 
 		 508 aa  946    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.727266  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1935  6-phosphogluconate dehydrogenase  74.47 
 
 		 521 aa  795    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1723  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.6 
 
 		 508 aa  933    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2561  6-phosphogluconate dehydrogenase  78.56 
 
 		 513 aa  833    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3220  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.02 
 
 		 517 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0151158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1609  6-phosphogluconate dehydrogenase  94.88 
 
 		 508 aa  999    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1684  6-phosphogluconate dehydrogenase  94.69 
 
 		 508 aa  998    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2724  6-phosphogluconate dehydrogenase  78.19 
 
 		 509 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1677  6-phosphogluconate dehydrogenase  94.49 
 
 		 508 aa  993    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2842  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.98 
 
 		 508 aa  945    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1365  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.12 
 
 		 511 aa  773    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1534  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.58 
 
 		 508 aa  941    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3505  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58.22 
 
 		 507 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2937  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.22 
 
 		 500 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.87 
 
 		 523 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.11 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.01 
 
 		 501 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.89 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.8 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  50 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.34 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  47.96 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.84 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.8 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.46 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.79 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.55 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.53 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.05 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.84 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.73 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.77 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.02 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  43.43 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.4 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.33 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.07 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.56 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.27 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.27 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.73 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.27 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.14 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.34 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.86 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.86 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.44 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  44.83 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.85 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.84 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.64 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.71 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.66 
 
 		 470 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07950  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.71 
 
 		 486 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.367535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.83 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 		 468 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.23 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.42 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.44 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.44 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.04 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.11 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.74 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.44 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.21 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.42 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.77 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.1 
 
 		 468 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.13 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.21 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.13 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  45.21 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.03 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.02 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36670  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.17 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26583  normal  0.322334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.65 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3089  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.17 
 
 		 489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.609606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>