63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2166 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  92.57 
 
 
296 aa  557  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  92.57 
 
 
296 aa  557  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.71 
 
 
296 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.78 
 
 
299 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.54 
 
 
298 aa  362  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 
297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 
297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 
297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.75 
 
 
306 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.66 
 
 
299 aa  348  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.36 
 
 
295 aa  347  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.86 
 
 
300 aa  345  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.42 
 
 
296 aa  343  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.42 
 
 
299 aa  340  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.76 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.75 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.19 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.95 
 
 
294 aa  335  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.27 
 
 
298 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57 
 
 
295 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.67 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.42 
 
 
296 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  55.71 
 
 
299 aa  325  8.000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.1 
 
 
296 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.86 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.3 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.07 
 
 
321 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.88 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.77 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.45 
 
 
298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.85 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  25.5 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  28.12 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  28.12 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.45 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  27.67 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  27.67 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  28.12 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  28.42 
 
 
339 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  29.69 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  26.87 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  29.23 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  25.97 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  27.36 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  28.06 
 
 
355 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  26.21 
 
 
355 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.06 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  23.36 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  31.79 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  24.67 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  25.52 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 
348 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  26.21 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  28.27 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  24.32 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  24.84 
 
 
339 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 
343 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  25.52 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  27.2 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  25.23 
 
 
340 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  23.85 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  25.66 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>