28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0605 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  784    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  82.32 
 
 		 396 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  82.32 
 
 		 396 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.08 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  35.16 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.62 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>