135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2460 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  55.41 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  45.86 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  42.41 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  44.59 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  41.4 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  41.4 
 
 
188 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  42.04 
 
 
167 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  41.61 
 
 
157 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  44.94 
 
 
156 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  42.04 
 
 
170 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  42.04 
 
 
170 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  38.85 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  45.57 
 
 
173 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  40.76 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  127  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  41.84 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  45.57 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  40.51 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  45.65 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  41.84 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  41.4 
 
 
159 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  40.13 
 
 
193 aa  125  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  41.32 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  46.76 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  38.22 
 
 
165 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  44.03 
 
 
161 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  40.12 
 
 
164 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  40.12 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  40.12 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  40.12 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  41.14 
 
 
157 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  39.24 
 
 
164 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  40.25 
 
 
160 aa  121  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  44.52 
 
 
157 aa  121  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  39.24 
 
 
159 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  42.22 
 
 
180 aa  120  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  38.12 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  41.36 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  40.38 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  36.99 
 
 
178 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  38.85 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  36.31 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0765  hypothetical protein  43.94 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0788  hypothetical protein  43.94 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  45.24 
 
 
242 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  46.4 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1759  hypothetical protein  40.61 
 
 
190 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  37.58 
 
 
168 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  39.49 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  38.12 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  38.22 
 
 
154 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  42.75 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  36.48 
 
 
164 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0603  hypothetical protein  38.1 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  41.43 
 
 
204 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  38.55 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0010  protein of unknown function DUF151  38.13 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06361  hypothetical protein  34.32 
 
 
194 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0431  protein of unknown function DUF151  40.79 
 
 
198 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000235563  normal  0.0443152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  44.53 
 
 
200 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1753  hypothetical protein  41.67 
 
 
201 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0351861  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  41.94 
 
 
200 aa  103  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  42.45 
 
 
197 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  37.32 
 
 
160 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  39.86 
 
 
158 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  31.18 
 
 
178 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2212  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000965632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1640  hypothetical protein  48.65 
 
 
293 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.398203  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0395  hypothetical protein  38.69 
 
 
219 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000988242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0431  protein of unknown function DUF151  40.32 
 
 
197 aa  99  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  38.64 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  37.21 
 
 
167 aa  97.8  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0462  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.086109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  33.09 
 
 
235 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  35.61 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  34.88 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  31.05 
 
 
191 aa  94.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0858  protein of unknown function DUF151  46.15 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0021  protein of unknown function DUF151  31.25 
 
 
216 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1740  protein of unknown function DUF151  42.31 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.2629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2005  hypothetical protein  42.06 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  0.331103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0583  protein of unknown function DUF151  35 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0008  protein of unknown function DUF151  41.22 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.756482  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0036  hypothetical protein  40.87 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2118  protein of unknown function DUF151  39.39 
 
 
288 aa  90.9  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13830  hypothetical protein  32.3 
 
 
171 aa  90.9  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0313  protein of unknown function DUF151  38.89 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  35.8 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  36.8 
 
 
146 aa  87.8  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0719  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  39.66 
 
 
360 aa  87.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0600107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0693  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  36.15 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1176  hypothetical protein  44.9 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0003  protein of unknown function DUF151  37.61 
 
 
238 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1050  hypothetical protein  34.59 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.931786 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1975  hypothetical protein  43.88 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2435  protein of unknown function DUF151  37.07 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>