19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4195 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.315174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  43.88 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0997  transcriptional regulator, putative  40.45 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.729204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0494  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.64 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.64 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4364  hypothetical protein  53.66 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0236727  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04070  transcriptional regulator  53.66 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4377  hypothetical protein  52.38 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.184663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>