22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1890 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  60.66 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  60.66 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  30.95 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  35.44 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  27.94 
 
 		 201 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  30 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  33.73 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  39.13 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  28.33 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  35.44 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  34.04 
 
 		 163 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34610  hypothetical protein  32.91 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  26.87 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  26.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  30.53 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  25.78 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  30.17 
 
 		 173 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  27.22 
 
 		 178 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>