36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_AR0050 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_AR0050  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  86.59 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  86.42 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  83.72 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  83.72 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  82.72 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21340  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0704715  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0414  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  82.67 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0042  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.755335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0060  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00028228  normal  0.398472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>