296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2190 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2190  TRm3 transposase  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.992374  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  90.22 
 
 
407 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  71.74 
 
 
406 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  83.7 
 
 
407 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  83.7 
 
 
407 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  83.7 
 
 
366 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  82.61 
 
 
366 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  70.65 
 
 
406 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  55.32 
 
 
408 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  64.13 
 
 
407 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  63.04 
 
 
407 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  63.04 
 
 
407 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  63.04 
 
 
407 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  63.04 
 
 
407 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  61.96 
 
 
407 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  61.96 
 
 
407 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0817  transposase  95.45 
 
 
236 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  54.55 
 
 
400 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  46.08 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  48.89 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  48.89 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  48.89 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0656  hypothetical protein  53.75 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.127003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2349  transposase mutator family protein  48.89 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  48.89 
 
 
422 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  60 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  47.78 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  47.78 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  47.78 
 
 
422 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  47.83 
 
 
416 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  47.83 
 
 
416 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  44.21 
 
 
419 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  44.21 
 
 
419 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  44.21 
 
 
419 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  44.21 
 
 
419 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  44.57 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  44.57 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  47.83 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  45 
 
 
411 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  46.74 
 
 
416 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  42.86 
 
 
408 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  42.86 
 
 
408 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  43.16 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0292  putative transposase, mutator type  43.33 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  43.48 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  45.59 
 
 
424 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  43.48 
 
 
415 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  45.65 
 
 
425 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  45.65 
 
 
425 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  45.65 
 
 
425 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  45.65 
 
 
425 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  41.3 
 
 
426 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  41.3 
 
 
426 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  41.3 
 
 
426 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  39.56 
 
 
403 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  43.16 
 
 
415 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  43.48 
 
 
425 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  45.07 
 
 
393 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3783  transposase, mutator type  40.22 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000372197  decreased coverage  0.000919258 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  43.68 
 
 
419 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  45.07 
 
 
404 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  43.68 
 
 
419 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  37.84 
 
 
447 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  42.53 
 
 
419 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  42.53 
 
 
419 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  42.53 
 
 
419 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  42.53 
 
 
419 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  42.53 
 
 
419 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>