More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1378 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1378  phosphotransacetylase  100 
 
 
588 aa  1158    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.926541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  83.2 
 
 
703 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  72.73 
 
 
697 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0834  phosphate acetyltransferase  79.01 
 
 
715 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239036  normal  0.0501662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1079  phosphate acetyltransferase  79.63 
 
 
716 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2007  phosphate acetyltransferase  79.01 
 
 
711 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  67.58 
 
 
715 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  76.15 
 
 
683 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  74.85 
 
 
703 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  67.5 
 
 
713 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  70.49 
 
 
687 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  67.22 
 
 
714 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  67.5 
 
 
712 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2479  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
714 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  67.86 
 
 
717 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2524  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
714 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1550  phosphate acetyltransferase  67.22 
 
 
717 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  67.49 
 
 
717 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  68.13 
 
 
717 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  68.13 
 
 
717 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2567  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
714 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  66.85 
 
 
729 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1442  phosphate acetyltransferase  67.22 
 
 
717 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  68.84 
 
 
712 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  68.13 
 
 
717 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2579  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
714 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2687  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
714 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  67.58 
 
 
717 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  68.51 
 
 
712 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  68.13 
 
 
717 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02222  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1359  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2591  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000450419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1826  phosphate acetyltransferase  67.22 
 
 
691 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1384  phosphate acetyltransferase  67.78 
 
 
713 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000919072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2673  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0331712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1355  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00139593  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02182  hypothetical protein  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  67.5 
 
 
712 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3437  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136418  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2447  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000498187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  67.98 
 
 
726 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  67.86 
 
 
717 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  67.86 
 
 
717 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  66.94 
 
 
715 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2453  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
714 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434183  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2841  phosphate acetyltransferase  67.6 
 
 
713 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.384349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  68.66 
 
 
712 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  68.18 
 
 
720 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  70.86 
 
 
712 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  65.55 
 
 
699 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2113  phosphate acetyltransferase  66.3 
 
 
723 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.330408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02943  phosphate acetyltransferase  65.19 
 
 
716 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  71.67 
 
 
691 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2591  phosphate acetyltransferase  71.47 
 
 
714 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.171095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  67.33 
 
 
713 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002967  phosphate acetyltransferase  66.39 
 
 
714 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.596051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  66.1 
 
 
713 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  69.6 
 
 
704 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3177  phosphate acetyltransferase  66.38 
 
 
706 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0503122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  69.32 
 
 
704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  66.01 
 
 
711 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
696 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0383  phosphate acetyltransferase  69.57 
 
 
711 aa  467  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0345  phosphate acetyltransferase  69.07 
 
 
715 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00951543  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  66.38 
 
 
717 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  66.57 
 
 
696 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02237  phosphate acetyltransferase  68.09 
 
 
692 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  65.91 
 
 
712 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  65.34 
 
 
699 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2896  phosphate acetyltransferase  64.9 
 
 
714 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2982  phosphate acetyltransferase  64.62 
 
 
714 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3087  phosphate acetyltransferase  64.62 
 
 
714 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  67.57 
 
 
718 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  64.49 
 
 
695 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  64.49 
 
 
695 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  67.27 
 
 
718 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  63.64 
 
 
695 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  64.49 
 
 
695 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0857  phosphate acetyltransferase  63.51 
 
 
699 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  48.02 
 
 
701 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  52.87 
 
 
696 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  59.1 
 
 
685 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  47.8 
 
 
704 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  47.8 
 
 
704 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  47.8 
 
 
704 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  47.68 
 
 
690 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  47.14 
 
 
706 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  44.42 
 
 
702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  47.26 
 
 
700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  46.58 
 
 
709 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  46.21 
 
 
691 aa  357  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  51.91 
 
 
698 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  55.65 
 
 
695 aa  356  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  55.29 
 
 
703 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  46.44 
 
 
707 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  54.14 
 
 
692 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  45.64 
 
 
704 aa  349  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  43.72 
 
 
707 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  43.5 
 
 
707 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>