20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0183 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 882 aa  1796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0850  hypothetical protein  85.71 
 
 		 115 aa  158  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  28.73 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  28.41 
 
 		 699 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  26.82 
 
 		 711 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  29.31 
 
 		 719 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  27.21 
 
 		 699 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  25.4 
 
 		 698 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  28.82 
 
 		 666 aa  69.7  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  25.71 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  27.35 
 
 		 744 aa  63.9  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  27.34 
 
 		 719 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  31.25 
 
 		 311 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  29.19 
 
 		 756 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2474  cold-shock DNA-binding protein family protein  33.85 
 
 		 181 aa  45.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.251539  normal  0.0229175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2537  cold-shock DNA-binding domain protein  33.87 
 
 		 74 aa  45.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2974  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 199 aa  45.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42307 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5567  cold shock protein  36.36 
 
 		 70 aa  44.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3462  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>