15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3310 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3635  hypothetical protein  96.81 
 
 		 94 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3449  hypothetical protein  70 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0009  hypothetical protein  70 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0007  hypothetical protein  69.23 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3105  hypothetical protein  71.26 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3583  hypothetical protein  68.97 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3259  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4118  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.457314  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4230  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3434  hypothetical protein  43.53 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1231  hypothetical protein  41.38 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1294  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218039  normal  0.118522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3875  hypothetical protein  33.71 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3989  hypothetical protein  33.71 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>