253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0253 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 336 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  96.13 
 
 		 336 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  88.96 
 
 		 339 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  66.03 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  66.24 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  55.15 
 
 		 369 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  55.08 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  54.77 
 
 		 323 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  53.39 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  54.52 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  55.29 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  55.29 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  54.98 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  54.28 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  54.08 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  56.33 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  53.54 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  44.81 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 321 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  41.81 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 		 319 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  43.21 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  33.47 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  36.62 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  33.47 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  35.81 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  35.81 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  32.86 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  28.46 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  33.06 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  27.46 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  26.46 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  30.37 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  28.95 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  28.42 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  29.86 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  29.1 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  25.63 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15761  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  25.63 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  28.63 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  27.52 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.35 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  24.9 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2814  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0934  hypothetical protein  30.07 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.464361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>