20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4453 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  79.25 
 
 		 535 aa  800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1068    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  80.37 
 
 		 535 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  63.24 
 
 		 525 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  47.3 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  37.48 
 
 		 497 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  46.46 
 
 		 587 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  41.94 
 
 		 623 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  32.37 
 
 		 532 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  27.35 
 
 		 587 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  26.99 
 
 		 588 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  34.88 
 
 		 599 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  34.2 
 
 		 597 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  34.2 
 
 		 597 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  35.9 
 
 		 597 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  33.1 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  37.18 
 
 		 344 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  38.24 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  29.33 
 
 		 349 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  40 
 
 		 347 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>