15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2107 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  100 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  70.75 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3467  Phage head-tail adaptor, putative  70.75 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0252975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1814  hypothetical protein  57.84 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00514089  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  36.17 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  31.07 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  40.24 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  39.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  38.75 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  37.66 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  33.33 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  47.62 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3392  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444321  hitchhiker  0.00000000238294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>