12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0034 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0034  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0160  hypothetical protein  84.81 
 
 		 314 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0049  hypothetical protein  88.64 
 
 		 307 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0442  hypothetical protein  80.87 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0208  hypothetical protein  77.62 
 
 		 326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0062  hypothetical protein  78.23 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.854831  normal  0.19763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0070  hypothetical protein  75.8 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2687  hypothetical protein  52.23 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0088  hypothetical protein  47.11 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3559  hypothetical protein  39.53 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0016  hypothetical protein  23.9 
 
 		 165 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.120709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>