62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2743 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2743  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1824  hypothetical protein  80.63 
 
 
306 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  59.78 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08260  conserved hypothetical protein TIGR00297  49.39 
 
 
281 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  40.73 
 
 
525 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  40.32 
 
 
509 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  41.2 
 
 
521 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  41.57 
 
 
526 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  41.27 
 
 
526 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4884  hypothetical protein  40.7 
 
 
273 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  39.6 
 
 
526 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  43.44 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  39.45 
 
 
401 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  36.32 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  34.72 
 
 
451 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  36.78 
 
 
516 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  31.46 
 
 
470 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6328  predicted protein  40.4 
 
 
274 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171794  hitchhiker  0.00792458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.64 
 
 
421 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  30.8 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  29.43 
 
 
408 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0182  hypothetical protein  37.55 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.649357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  33.91 
 
 
401 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  27.55 
 
 
236 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1573  hypothetical protein  34.42 
 
 
399 aa  85.5  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  34.22 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  33.69 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  33.69 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0829  hypothetical protein  33.85 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  30.37 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1205  hypothetical protein  37.56 
 
 
245 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1227  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.14 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0151  hypothetical protein  38.03 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  28.83 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3253  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.33 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01270  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.824166  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1613  hypothetical protein  30.04 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1546  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.94 
 
 
448 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.95 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0166  hypothetical protein  38 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  33 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0192  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.66 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23959  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  30.3 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  29.8 
 
 
245 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10054  predicted protein  28.03 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07821  hypothetical protein  27.82 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598038 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07615  DUF92 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15640)  32.61 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.128919  normal  0.630867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3203  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  29.29 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.51 
 
 
248 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  27.36 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1453  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.87 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  27.94 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2185  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.5 
 
 
430 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0972552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3558  hypothetical protein  24.31 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5222  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.88 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  27 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  27 
 
 
247 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5597  predicted protein  27.38 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>