277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1008 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 54 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  96.3 
 
 		 54 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 		 54 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0329  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000323722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0428  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1919  ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 50 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  63.04 
 
 		 54 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1453  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.7102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  52.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  57.41 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  53.57 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  57.78 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  49.02 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  47.06 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  56.6 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>