159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0428 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0428  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 52 aa  102  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1919  ribosomal protein L33  63.83 
 
 		 50 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1711  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 51 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 51 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  48.08 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  48.08 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 51 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  64.44 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 55 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 51 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 49 aa  50.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 51 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3205  50S ribosomal protein L33P  47.17 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 54 aa  48.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 51 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0039  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  52.08 
 
 		 51 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0329  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000323722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0090  ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  41.51 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  47.17 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  47.92 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70180  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  46.3 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000810994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6091  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 51 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3680  50S ribosomal protein L33P  45.83 
 
 		 51 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213353  normal  0.0395142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  40.35 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1453  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 55 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.7102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  46.3 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1116  50S ribosomal protein L33P  47.17 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>