25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0362 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  75.7 
 
 		 319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  34.83 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  32.92 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  34.23 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  32.14 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  31.97 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  28.18 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  29.47 
 
 		 698 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  28.71 
 
 		 699 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  28.32 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  29.05 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  26.76 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  32.82 
 
 		 711 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  26.47 
 
 		 699 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.51 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  36.29 
 
 		 670 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 719 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.12 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  27.15 
 
 		 661 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  23.9 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  33.65 
 
 		 698 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  25.41 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  24.48 
 
 		 744 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  27.32 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>