23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0143 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  41.21 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3377  Appr-1-p processing domain protein  39.34 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.590192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0008  appr-1-p processing domain-containing protein  40.91 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00352101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2793  appr-1-p processing enzyme family protein  35.57 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  31.52 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  33.71 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  44.54 
 
 		 293 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0273  phosphatase like to the domain of histone macroH2A1  33.72 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0099  Appr-1-p processing domain protein  30.51 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06361  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.84373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4137  Appr-1-p processing domain-containing protein  26.23 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0560  Appr-1-p processing domain protein  30.29 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  27.27 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  28.85 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  27.27 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  28.87 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  29.37 
 
 		 599 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  29.88 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  26.58 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  28.83 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>