10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1908 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1908  cupin 2, barrel-containing protein  100 
 
 		 116 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  91.15 
 
 		 113 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0361  cupin 2, barrel  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4743  cupin 2 domain-containing protein  55.05 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0126  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.21 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1778  cupin 2 domain-containing protein  48.15 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0617369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5057  cupin 2 domain-containing protein  46.43 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11732  hypothetical protein  41.77 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0442429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 115 aa  40  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>