35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1504 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  212  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00020408  hitchhiker  0.00792133 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4221  hypothetical protein  70.71 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  61.84 
 
 		 333 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  61.84 
 
 		 333 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  61.84 
 
 		 333 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  61.84 
 
 		 333 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  62.16 
 
 		 345 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  62.16 
 
 		 323 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  65.22 
 
 		 318 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  54.76 
 
 		 329 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  68.25 
 
 		 306 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  68.25 
 
 		 306 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  55.17 
 
 		 334 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  55.17 
 
 		 334 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  62.16 
 
 		 255 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  62.16 
 
 		 333 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  62.16 
 
 		 366 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  62.16 
 
 		 356 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  62.16 
 
 		 334 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  62.16 
 
 		 334 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  62.16 
 
 		 359 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3308  putative transposase  44.16 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  58.7 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  58.7 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  58.7 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  58.7 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>