35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4221 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4221  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1504  hypothetical protein  70.71 
 
 
102 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00020408  hitchhiker  0.00792133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  64.79 
 
 
333 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  64.79 
 
 
333 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  64.79 
 
 
333 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  64.79 
 
 
333 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  57.65 
 
 
345 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  57.65 
 
 
323 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  54.88 
 
 
329 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  62.86 
 
 
318 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  68.25 
 
 
306 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  68.25 
 
 
306 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  62.86 
 
 
255 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  62.86 
 
 
334 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  62.86 
 
 
334 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  62.86 
 
 
366 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  62.86 
 
 
356 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  62.86 
 
 
334 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  62.86 
 
 
334 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  62.86 
 
 
333 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  62.86 
 
 
359 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3308  putative transposase  45.83 
 
 
238 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  58.7 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  58.7 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  58.7 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  58.7 
 
 
338 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>