73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0870 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0351684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2899  hypothetical protein  70.49 
 
 		 190 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0471  hypothetical protein  70.49 
 
 		 190 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0498  hypothetical protein  70.49 
 
 		 190 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2607  hypothetical protein  70.49 
 
 		 190 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2457  hypothetical protein  74.73 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3586  hypothetical protein  69.95 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2941  hypothetical protein  72.53 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2733  hypothetical protein  70.79 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0403  hypothetical protein  70.22 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3616  hypothetical protein  69.02 
 
 		 283 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3604  hypothetical protein  69.02 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3629  hypothetical protein  69.02 
 
 		 207 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0429  hypothetical protein  68.31 
 
 		 190 aa  264  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1734  hypothetical protein  68.48 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0032  hypothetical protein  68.48 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3168  hypothetical protein  68.48 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2809  hypothetical protein  68.48 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3534  protein of unknown function DUF1415  65.57 
 
 		 194 aa  257  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0424  hypothetical protein  65.71 
 
 		 184 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5572  hypothetical protein  60.92 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2114  hypothetical protein  63.69 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1040  hypothetical protein  59.34 
 
 		 201 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2963  hypothetical protein  59.2 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.351971  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0480  hypothetical protein  56.21 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3518  hypothetical protein  56.73 
 
 		 178 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0706  protein of unknown function DUF1415  58.24 
 
 		 205 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1005  hypothetical protein  53.93 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0544  hypothetical protein  56.21 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2929  hypothetical protein  57.69 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03086  hypothetical protein  57.8 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3491  protein of unknown function DUF1415  56.5 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1246  hypothetical protein  57.89 
 
 		 182 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1149  protein of unknown function DUF1415  54.24 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3336  protein of unknown function DUF1415  59.14 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2989  protein of unknown function DUF1415  60.34 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3054  hypothetical protein  58.33 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2224  protein of unknown function DUF1415  52.76 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0737  hypothetical protein  57.05 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2881  hypothetical protein  49.39 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1556  hypothetical protein  47.27 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.996386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02137  hypothetical protein  37.99 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1226  hypothetical protein  40.72 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1818  protein of unknown function DUF1415  44.91 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0209901  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0293  hypothetical protein  43.29 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003684  hypothetical protein  39.64 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2220  hypothetical protein  40.34 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2192  hypothetical protein  42.07 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2030  hypothetical protein  41.92 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1157  hypothetical protein  39.78 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3140  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0840937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1393  hypothetical protein  40.46 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0285397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1526  hypothetical protein  37.71 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1683  hypothetical protein  35.59 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0614487  unclonable  0.00000199628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02963  hypothetical protein  40.34 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.058158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2825  protein of unknown function DUF1415  37.14 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1492  hypothetical protein  34.86 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0122301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1559  hypothetical protein  36.57 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1715  hypothetical protein  37.02 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1530  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1845  hypothetical protein  35 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3180  hypothetical protein  35.63 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.588963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1428  hypothetical protein  36.46 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2635  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2568  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2743  hypothetical protein  35.43 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0230588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2756  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2233  hypothetical protein  33.53 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1353  hypothetical protein  36.94 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2979  hypothetical protein  35.58 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36742  predicted protein  32.47 
 
 		 288 aa  97.8  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.905252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45717  predicted protein  25.99 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33635  predicted protein  30.13 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728091  normal  0.688241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>