17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1718 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1718  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 152 aa  306  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000108477  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02755  hypothetical protein  42.95 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0259  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.352698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0779  hypothetical protein  35.04 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.06 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.71 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  33.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  29.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  28.8 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.92 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 136 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.27 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  26.95 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>