25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1451 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 		 84 aa  167  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3487  protein of unknown function UPF0175  49.38 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3500  hypothetical protein  39.51 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3294  protein of unknown function UPF0175  41.33 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.214497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2063  protein of unknown function UPF0175  41.46 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1770  protein of unknown function UPF0175  37.97 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00752388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  38.57 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3139  protein of unknown function UPF0175  48.08 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2970  protein of unknown function UPF0175  48.08 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2857  protein of unknown function UPF0175  39.47 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1189  hypothetical protein  37.18 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.146128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2800  protein of unknown function UPF0175  34.83 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  37.14 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  32.5 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0158  protein of unknown function UPF0175  34.29 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  42.42 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2554  protein of unknown function UPF0175  41.67 
 
 		 96 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.416067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  37.5 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2867  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.958212  hitchhiker  0.00224832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  38.6 
 
 		 83 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>