37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6975 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
81 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  67.09 
 
 
82 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  62.96 
 
 
82 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  62.2 
 
 
106 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  60.98 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  51.9 
 
 
85 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  51.85 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  47.73 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  46.15 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  44.05 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  41.98 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  38.37 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  34.94 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  44.16 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  34.15 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  38.55 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  39.29 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  31.76 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  30.23 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  30.23 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  40.3 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  36.84 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  32.93 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  34.15 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  28.05 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  34.15 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  35.29 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  36.59 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  33.78 
 
 
89 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>