12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5676 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  62.97 
 
 		 690 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1418    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  34.5 
 
 		 663 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  23.16 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  23.55 
 
 		 705 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4556  hypothetical protein  22.17 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000198635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  20.61 
 
 		 721 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  28.97 
 
 		 718 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  20.32 
 
 		 683 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  23.53 
 
 		 690 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  27.46 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 670 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>