24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5622 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  100 
 
 		 332 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  67.88 
 
 		 335 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  55.27 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  29.37 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  28.71 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  27.6 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  28.9 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  27.67 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  45.12 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  26.03 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  35.9 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  33.71 
 
 		 133 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  21.94 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  22.28 
 
 		 407 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  34.31 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  32.67 
 
 		 235 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  31.94 
 
 		 128 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  32.39 
 
 		 128 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  26.89 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>