33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5298 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  79.52 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  85.71 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  71.21 
 
 		 81 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.95 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.61 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  66.67 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  55.32 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  43.24 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  54.76 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.68 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  36.59 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.28 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  35 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  53.49 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  32.86 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06880  hypothetical protein  28.77 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.613488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  28.57 
 
 		 83 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.71 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  34.43 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  34.43 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  42.5 
 
 		 83 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  46.51 
 
 		 85 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>