19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2972 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2972  response regulator receiver protein  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213987 
 
 
-
 
NC_004310  BR1487  hypothetical protein  45.45 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1442  hypothetical protein  45.63 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0660  hypothetical protein  37.08 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2313  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1253  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0572  response regulator receiver protein  35.98 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0223  response regulator receiver protein  32.27 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.752247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2826  response regulator receiver protein  28 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3366  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1608  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483087  normal  0.451754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2128  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0265742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3222  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2028  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1025  response regulator receiver protein  25.11 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2467  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 305 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.18 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>