13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2971 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  314  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  51.83 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  51.83 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  37.11 
 
 
172 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  48.91 
 
 
178 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  46.49 
 
 
128 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  39.06 
 
 
128 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  43.2 
 
 
185 aa  84.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  40 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  42.86 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  35.96 
 
 
186 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  37.5 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3822  hypothetical protein  31.51 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>