34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6047 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6047  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2834  hypothetical protein  43.33 
 
 
427 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5048  hypothetical protein  36.26 
 
 
458 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.319901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3564  hypothetical protein  36.58 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0365103  normal  0.100331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0515  hypothetical protein  42.31 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25002  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3660  hypothetical protein  38.64 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30987  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3861  hypothetical protein  39.24 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4703  hypothetical protein  38.64 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408696  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5406  hypothetical protein  39.79 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2448  hypothetical protein  38.18 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755524  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0089  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2685  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0106  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1528  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1249  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1083  hypothetical protein  44.5 
 
 
427 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4058  hypothetical protein  41.18 
 
 
422 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0397  hypothetical protein  43.94 
 
 
427 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0945  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.18 
 
 
444 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.37 
 
 
468 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  37.56 
 
 
476 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7205  hypothetical protein  80 
 
 
44 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226033  normal  0.0324318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  40.51 
 
 
221 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 
230 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.35 
 
 
210 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.97 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.97 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  37.97 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  37.97 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  32.11 
 
 
233 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  37.97 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  35.44 
 
 
238 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  31.15 
 
 
207 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  32.5 
 
 
98 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>