48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5272 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5272    100 
 
 		 630 bp  1249    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  85.71 
 
 		 666 bp  89.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 984 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    83.7 
 
 		 2579 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 990 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 990 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 861 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 990 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  94.64 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  87.36 
 
 		 1392 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2781    83.61 
 
 		 579 bp  83.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  84.76 
 
 		 336 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    92.45 
 
 		 950 bp  73.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  83.02 
 
 		 567 bp  67.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  88.52 
 
 		 993 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  88.52 
 
 		 993 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    88.52 
 
 		 672 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    88.52 
 
 		 1031 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  88.52 
 
 		 993 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  88.52 
 
 		 993 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    88.52 
 
 		 1062 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  88.52 
 
 		 993 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  89.8 
 
 		 966 bp  58  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  86.89 
 
 		 1068 bp  58  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  86.89 
 
 		 1047 bp  58  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  96.77 
 
 		 780 bp  54  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0525    88.24 
 
 		 789 bp  54  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  96.77 
 
 		 951 bp  54  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  87.04 
 
 		 960 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    87.04 
 
 		 980 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  87.04 
 
 		 960 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  87.04 
 
 		 960 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  87.04 
 
 		 621 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  87.04 
 
 		 960 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 843 bp  50.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  90.24 
 
 		 912 bp  50.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>