19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4723 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  46.45 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  45.92 
 
 
374 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  45.38 
 
 
362 aa  279  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  41.87 
 
 
365 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  25.7 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  26.76 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  25.08 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  25.35 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  29.65 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  27.11 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  29.28 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  22.17 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3716  hypothetical protein  24.37 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7695  hypothetical protein  25.39 
 
 
371 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  24.66 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  24.7 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  24.7 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  24.7 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>