12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4276 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4276  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4541  hypothetical protein  92.61 
 
 
216 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3493  hypothetical protein  78.33 
 
 
209 aa  318  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1740  hypothetical protein  52.68 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6049  hypothetical protein  51.27 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2240  hypothetical protein  49.03 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1289  hypothetical protein  45.62 
 
 
218 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.0554205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  38.81 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  40.3 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1223  peptidase M15A  24.38 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2302  hypothetical protein  23.27 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>