9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3493 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4276  hypothetical protein  78.33 
 
 		 205 aa  317  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4541  hypothetical protein  77.45 
 
 		 216 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1740  hypothetical protein  50.24 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6049  hypothetical protein  52.79 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2240  hypothetical protein  47.62 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1289  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.0554205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  29.09 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  38.71 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>