23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4024 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  94.2 
 
 
69 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  75.36 
 
 
69 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  73.53 
 
 
74 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  53.97 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  53.97 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  46.88 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  42.65 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  40 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  37.5 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  36.76 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  36.11 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  36.11 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  38.1 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  37.14 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  44.29 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  38.36 
 
 
70 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  38.67 
 
 
72 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5532  SlyX family protein  45.65 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438123  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  30 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  35.94 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>