26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3610 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  70.89 
 
 
82 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  62.96 
 
 
81 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  62.2 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  56.1 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  50.62 
 
 
83 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  51.9 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  51.32 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  47.69 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  38.27 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  31.76 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  35.9 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  35.9 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
93 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  29.21 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  32.14 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  36.59 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  32.14 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  32.93 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>