11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3661 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3661  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4986  hypothetical protein  50.18 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  23.95 
 
 		 743 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  22.51 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1061  hypothetical protein  32.93 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.820088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  27.1 
 
 		 773 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04716  alpha-1,6-mannosyltransferase subunit (Och1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08580)  23.15 
 
 		 362 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72561  predicted protein  24.77 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  25.38 
 
 		 788 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  23.64 
 
 		 907 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  22.22 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>