19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3651 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  932    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  63.48 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  57.42 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  51.69 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  50.71 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  50.84 
 
 		 583 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  50.57 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  47.6 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  49.1 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  38.13 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  33.51 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  27.51 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  30.74 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  27.63 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  28.9 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  27.47 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  23.83 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  28.02 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  28.65 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>